Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek5Q7TSC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek5Q7TSC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek5Q7TSC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek5Q7TSC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms