Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Prrc2bQ7TPM1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prrc2bQ7TPM1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Prrc2bQ7TPM1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Prrc2bQ7TPM1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms