Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TwistnbQ78WZ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TwistnbQ78WZ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TwistnbQ78WZ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwistnbQ78WZ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwistnbQ78WZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwistnbQ78WZ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwistnbQ78WZ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwistnbQ78WZ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms