Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms