Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnih3Q6ZWS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnih3Q6ZWS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnih3Q6ZWS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnih3Q6ZWS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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