Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88cQ6VGS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms