Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr13Q6R5N8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr13Q6R5N8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tlr13Q6R5N8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr13Q6R5N8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms