Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4Q6PHQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms