Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf4Q6PFF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scaf4Q6PFF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf4Q6PFF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf4Q6PFF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms