Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1cQ6PDZ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf1cQ6PDZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1cQ6PDZ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1cQ6PDZ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms