Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smchd1Q6P5D8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smchd1Q6P5D8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smchd1Q6P5D8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smchd1Q6P5D8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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