Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg2aQ6P4T0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2aQ6P4T0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2aQ6P4T0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms