Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RbfaQ6P3B9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RbfaQ6P3B9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 928.2 ms