Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggnbp1Q6K1E7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggnbp1Q6K1E7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggnbp1Q6K1E7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms