Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms