Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ablim3Q69ZX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ablim3Q69ZX8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ablim3Q69ZX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms