Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim24Q64127 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim24Q64127 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms