Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nup62Q63850 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nup62Q63850 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62Q63850 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62Q63850 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms