Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Itga6Q61739 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itga6Q61739 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Itga6Q61739 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Itga6Q61739 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms