Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim25Q61510 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim25Q61510 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim25Q61510 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim25Q61510 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms