Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igbp1Q61249 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Igbp1Q61249 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Igbp1Q61249 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igbp1Q61249 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms