Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf4Q60793 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf4Q60793 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms