Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P4ha1Q60715 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P4ha1Q60715 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P4ha1Q60715 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms