Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm1Q60636 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Prdm1Q60636 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm1Q60636 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms