Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema5bQ60519 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5bQ60519 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema5bQ60519 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema5bQ60519 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms