Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms