Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim38Q5SZ99 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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