Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Specc1Q5SXY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Specc1Q5SXY1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Specc1Q5SXY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms