Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsr1Q5SWD9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsr1Q5SWD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms