Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9930111J21Rik1Q5SVP0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms