Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc92bQ5SUE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92bQ5SUE3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92bQ5SUE3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc92bQ5SUE3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms