Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo39Q5NBU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo39Q5NBU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms