Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20816Q5FWD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20816Q5FWD4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20816Q5FWD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.2 ms