Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3558Q5FWC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3558Q5FWC9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3558Q5FWC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms