Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf2Q59J78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf2Q59J78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf2Q59J78 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms