Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms