Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otol1Q4ZJM7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otol1Q4ZJM7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otol1Q4ZJM7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms