Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Fam228bQ497Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam228bQ497Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms