Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930596D02RikQ3V0H9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms