Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garnl3Q3V0G7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Garnl3Q3V0G7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garnl3Q3V0G7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garnl3Q3V0G7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms