Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm6Q3UZD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm6Q3UZD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms