Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox3Q3UT54 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Obox3Q3UT54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms