Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UPC7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3UPC7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q3UPC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3UPC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3UPC7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3UPC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3UPC7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3UPC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UPC7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1069 ms