Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ankrd27Q3UMR0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd27Q3UMR0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd27Q3UMR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms