Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uspl1Q3ULM6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uspl1Q3ULM6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uspl1Q3ULM6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uspl1Q3ULM6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uspl1Q3ULM6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uspl1Q3ULM6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uspl1Q3ULM6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uspl1Q3ULM6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Uspl1Q3ULM6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms