Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx27Q3UHD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx27Q3UHD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx27Q3UHD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms