Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l3bQ3UD01 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l3bQ3UD01 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms