Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem109Q3UBX0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem109Q3UBX0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms