Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctu2Q3U308 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu2Q3U308 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms