Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rnf149Q3U2C5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rnf149Q3U2C5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rnf149Q3U2C5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf149Q3U2C5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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